Scipy稀疏矩阵bsr_array如何使用

其他教程   发布日期:2023年06月28日   浏览次数:345

本篇内容主要讲解“Scipy稀疏矩阵bsr_array如何使用”,感兴趣的朋友不妨来看看。本文介绍的方法操作简单快捷,实用性强。下面就让小编来带大家学习“Scipy稀疏矩阵bsr_array如何使用”吧!

基本原理

bsr,即Block Sparse Row,bsr_array即块稀疏行矩阵,顾名思义就是将稀疏矩阵分割成一个个非0的子块,然后对这些子块进行存储。通过输入维度,可以创建一个空的bsr数组,但bsr格式并不可见,需要通过toarray转为数组,才能一窥全貌。

from scipy.sparse import bsr_array
import numpy as np
import sys
bsr = bsr_array((100, 200), dtype=np.int8)
sys.getsizeof(bsr)      # 48
bsr_arr = bsr.toarray() # 转为数组
sys.getsizeof(bsr_arr)  # 20120

egtsizeof可查看数据占用的内存,其中bsr占用48byte,转为数组之后占据20k,这就是稀疏矩阵存在的价值。

当然,全零的数组就直接叫全零数组得了,直接存个行列数比bsr还省事儿,接下来构造一个矩阵

from numpy.random import randint, rand
tmp = np.zeros([200,200])
for i in range(30):
    x, y = randint(195, size=(2))
    tmp[x:x+5, y:y+5]=rand(5,5)

print(tmp.size)            # 40000
bsr = bsr_array(tmp, blocksize=(5,5))    
print(bsr.data.size)       # 2850
print(bsr.indptr.size)     # 41
print(bsr.indices.size)    # 114
print(tmp.size)

bsr.data是bsr中存放的矩阵块;bsr.indices为这些矩阵块对应的列号数组;bsr.indptr为索引的行分割数组;这些零零碎碎加在一起也只有3005个数,和40k的tmp相比,可以说压缩效率非常高了。

通过data, indptr和indices,可以将bsr复原为矩阵。首先,列号和数据是一一对应的;其次indptr对索引和数据按行分割。在本例中,indptr的值为0, 2, 6, 8…,则data[0:2]存放在第0行,对应的列号为indices[0:2];data[2:6]存放在第1行,对应的列号为indices[2:6],以此类推。

初始化

bsr_array共有5种初始化方案:

  • bsr_array(D) D是一个稀疏数组或2 × D 2 imes D2×D数组

  • bsr_array(S) S是另一种稀疏数组

  • bsr_array((M, N),dtype) 创建一个shape为( M , N ) (M, N)(M,N)的空数组,dtype为数据类型

  • bsr_array((data, ij)) ij是坐标数组,可分解为i,j=ij,data是数据数组,设新矩阵为a,则a[i[k], j[k]] = data[k]

  • bsr_array((data, indices, indptr))

前四种方法均有参数blocksize,为块尺寸;后两种方法均有参数shape,为稀疏矩阵的维度。

从原理上来说,通过data, indices, indptr来创建的bsr数组,属于"原生"的bsr数组,其创建规则就是前文提到的复原规则。

内置方法

稀疏数组在计算上并不便捷,所以bsr_array中内置了下列函数,可以高效地完成计算。



函数
expm1
,
log1p
,
sqrt
,
pow
,
sign
三角函数
sin
,
tan
,
arcsin
,
arctan
,
deg2rad
,
rad2deg
双曲函数
sinh
,
tanh
,
arcsinh
,
arctanh
索引
getcol
,
getrow
,
nonzero
,
argmax
,
argmin
,
max
,
min
舍入
ceil
,
floor
,
trunc
变换
conj
,
conjugate
,
getH
统计
count_nonzero
,
getnnz
,
mean
,
sum
矩阵
diagonal
,
trace
获取属性
get_shape
,
getformat
计算比较
multiply
,
dot
,
maximum
,
minimum
转换
asformat
,
asfptype
,
astype
,
toarray
,
todense
转换
tobsr
,
tocoo
,
tocsc
,
tocsr
,
todia
,
todok
,
tolil
更改维度
set_shape
,
reshape
,
resize
,
transpose
排序
sort_indices
,
sorted_indices
移除元素
eliminate_zeros
,
prune
,
sum_duplicates
其他
copy
,
check_format
,
getmaxprint
,
rint
,
setdiag

以上就是Scipy稀疏矩阵bsr_array如何使用的详细内容,更多关于Scipy稀疏矩阵bsr_array如何使用的资料请关注九品源码其它相关文章!